Le origini remote del Santuario della Madonna della Ceriola risalgono circa alla metà del V secolo, quando San Vigilio, Vescovo di Brescia, portò la fede nella zona del Sebino sopprimendo il culto della dea pagana Iside(da cui deriva il nome iseo).La fede del Cristo Salvatore si divulgò ben presto, San Vigilio portò devozione anche alla Madre del Cristo:la Madonna.
Appoggiato su uno spuntone di roccia grigia dell' era mesozoica, sorge il Santuario della Madonna della Ceriola, che rappresenta il punto più suggestivo dell' isola.San Vigilio pensò di fare erigere su quella vetta una piccola cappella, dedicandola alla purificazione della Beata Vergine Maria,come simbolo delle purificazioni dalle superstzioni pagane e simbolo della nuova luce del Cristianesimo.
La piccola chiesa fu la prima parrocchia dell' isola, chiamata SANTA MARIA DE CURIS come appare nel catalogo dei beni della diocesi di Brescia compilato nel 1410, inoltre fu anche la prima chiesa del lago dedicata alla Madonna. Successivamente divenne Madonna della Ceriola, perchè l' effige della Madonna(XII sec.) venne scolpita in un ceppo di cerro. E' stata intagliata seduta su di un trono, con un ampio manto, con in braccio il Bambino.

Il 14 marzo del 1580, San Carlo Borromeo, Arcivescovo di Milano, passando in visita sulle strade bresciane, manda il suo convisitatore Don Ottavio Abbiati sull' isola a visitare il Santuario. Di questa visita stende una relazione in cui scrive:" Santuario ampio e decente, altare unico consacrato, come pure la chiesa, pitture avariate, trittico con la statua della vergine".
Dopo questa visita il rettore della parrocchia Francesco Augustinelli ne ordina il restauro cambiandoquasi completamente la struttura originaria.Nell' ampliamento costruì il nuovo presbiterio che portò maggior proporzione all' insieme.Viene posta l' artistica cancellata in ferro battuto, dividendo così la zona sacra dalla zona riservata ai fedeli.Il vecchio tetto a capanna viene sostituito dalla volta a botte, e vengono aperte la due cappelle laterali dove sarà collocato l' altare di San Fermo e più tardi quello del TRANSITO DI S.GIUSEPPE del Paglia.
I lavori finiscono all' inizio del '600 (come attesta la scritta sull' architravedel portale della facciata"Francesco Augustinelli presbiteris Rettoris Ope 1600").